VMD
VMD أحدثت صناعة تصميم 3D CAD ثورة في مختلف القطاعات بما في ذلك كلمة البيولوجيا الجزيئية. باستخدام هذا البرنامج ، يمكن للمستخدم بسهولة عرض البروتينات وأنواع أخرى من الجزيئات ، وتحريكها من خلال تقنية ثلاثية الأبعاد وتقنية برمجة نصية مخصصة. واجهة التطبيق بسيطة ، مما يسهل على المستخدمين الجدد التنقل. سيحب المستخدمون ذوو الخبرة العرض عالي الجودة للمشاهد الجزيئية مما يجعلها تفاعلية للغاية. يمكنه بسهولة تحليل الهياكل الضخمة التي تحتوي على أكثر من مليون ذرة.
VMD
يتم تجميع العديد من الجزيئات مع التطبيق افتراضيًا. ولكن يمكن للمستخدم أيضًا إضافة المزيد من الجزيئات إلى البرنامج باستخدام ميزة متصفح ملفات الجزيئات في التطبيق. يحتوي البرنامج على ميزة ذكية تكتشف تلقائيًا نوع الملفات التي تم تحميلها. ومع ذلك ، لدى المستخدم خيار تحديد حجم الملف يدويًا عندما تكون ميزة اكتشاف التطبيق غير دقيقة.
بعد أن تعرض نافذة OpenGL Display مرئيات للجزيئات المحملة ، يمكن للمستخدم تحديد أي جزء من الهيكل وتغيير اللون وإضافة المزيد من المواد وإنشاء ملصقات. يمكن زيادة ميزات البرنامج باستخدام الامتدادات. إذا كنت تدرس الفيزياء الحيوية ، فهذا البرنامج ممتاز بالنسبة لك.
تطبيق قوي مصمم لتوفير وسيلة للنظر إلى الأنظمة الجزيئية الحيوية من أجل إجراء تحليل الجزيئات أو المهام المماثلة
قد يبدو التحليل الجزيئي أو تصور النظام البيولوجي وكأنه أنشطة معقدة للغاية والحقيقة هي أنها في الواقع معقدة للغاية. عادة ، المتخصصون وأولئك الذين يدرسون الفيزياء الحيوية هم فقط من سيصادفون هذه المفاهيم على أساس منتظم ، ولكن نظرًا لوجود تطبيقات برمجية وثيقة الصلة بهم ، يمكن لأي شخص تقريبًا الحصول على نظرة ثاقبة حول كل هذا.
VMD هي إحدى الأدوات المساعدة التي تشارك بشكل مباشر في التعامل مع البروتينات وكذلك الأنواع الأخرى من الجزيئات. يمكنك استخدامه لعرض البنية المعقدة لهذه الجسيمات ، ولكن أولئك الذين لديهم خبرة في المجال المذكور أعلاه سيستفيدون إلى أقصى حد من هذه الأداة.
الواجهة ليست معقدة على الإطلاق ، فقط الميزات التي تستضيفها قد تبدو للعين غير المدربة. هناك الكثير من الموارد ، معظمها عبر الإنترنت ، والتي يمكن أن تساعدك على فهم مفاهيم وأداء هذا البرنامج ، والتي ستكون مفيدة جدًا لأي شخص.
فيما يلي بعض الجزيئات التي تم تجميعها مع VMD ، ولكن يمكنك تحديد بعض الجزيئات الخاصة بك باستخدام "متصفح ملفات الجزيء" المخصص. هناك خيار لاكتشاف نوع الملف الذي تم تحميله تلقائيًا ومن المستحسن الاحتفاظ به على هذا النحو ، ما لم تكن تعلم حقيقة أن النوع الذي يقدمه التطبيق يختلف عن المحتوى الفعلي للملف المحدد.
ستظهر لك نافذة OpenGL Display التمثيل الرسومي للجزيئات التي تختارها ويمكن تخصيص الألوان والمواد والملصقات من الوحدات المخصصة لـ VMD. أيضًا ، يمكن تعديل خيارات العرض بسهولة حتى تتمكن من اختيار الإضاءة أو المحاور أو نوع الخلفية المطلوب.
بفضل المجموعة الرائعة من الوظائف والإضافات المتوفرة أو التي يمكن إضافتها داخل VMD ، يتمكن هذا البرنامج من توفير جميع الأدوات اللازمة لأي شخص مشارك في ممارسة أو دراسة الفيزياء الحيوية.
